iOS9.3の不具合報告がいろいろ報告されています。
致命的で解決不能な深刻なものはあがっていないようですが、不具合と一部その対処法を一覧にしているサイトがあったのでリンクを貼っておきます。
にゅーすばんくさんから
この記事のなかでも触れられているiPhoneがアクティベートできないという現象がありますが、僕の場合はちょっと似たような現象が後で発見されました。
iPhone自体は問題なく動いているのですが、有名なto doアプリのDueで 「App Storeのレシートが見つからない、または認証できません。新しいレシートを認証できるようにリフレッシュしてください」という画面が出てきました。
言ってみれば特定のアプリがアクティベートできないような現象ですね。
そのあとガイダンスが続いて出てきてiTune Storeのパスコードを入力することで解決しました。
iPhoneがアクティベートできない現象の解決策と、これからアップデートする場合に同様の現象が起きないためのアップデートの方法はこの記事に載っています。
こちらもにゅーすばんくさんから
まあ、アップデートにはなんらか起こりますよね。